Imagerie rapide et traitements temps réel
R&D Vision a fourni à l’Institut des Neurosciences Paris-Saclay — NeuroPSI — un dispositif d’imagerie haute fréquence images et haute sensibilité. Ce dispositif enregistre des images sans perte d’information pendant une longue durée, tout en permettant la quantification de certaines caractéristiques des images en temps réel à 100 Hz.
Mesurer une fluorescence provoquée par des marqueurs de l’activité neuronale du cortex
L’objectif est d’imager un petit champ de 5 mm de côté à l’aide d’un macroscope afin d’observer des vagues dynamiques de fluorescence. Cette fluorescence est provoquée par des marqueurs de l’activité neuronale du cortex, mesurés à une échelle mésoscopique. Il est nécessaire de suivre en temps réel les propriétés de ces vagues, afin de pouvoir effectuer une rétroaction sur le système biologique étudié.
Malgré des modulations de luminosité faibles dans des fonds lumineux élevés, R&D Vision a privilégié, en première approche, l’utilisation d’une caméra de vision industrielle « standard » et non l’utilisation d’une caméra scientifique onéreuse. Cette approche fut payante et les images obtenues en adéquation avec les caractéristiques requises pour les traitements d’images.
Approche CPU ou FPGA ?
Afin de respecter un temps de traitement maximum de l’ordre de 10 ms par image, l’utilisation du CPU ou d’une carte FPGA a été évaluée. De par la nature des traitements utilisés, c’est finalement l’approche CPU qui a été retenue. Les algorithmes développés en partenariat avec l’institut ont tous été évalués en temps d’exécution et en sensibilité. Des optimisations ont été réalisées ensuite pour respecter les performances attendues (qualité des informations recueillies et vitesse d’exécution).
Pour que les utilisateurs soient en mesure d’adapter et de modifier les algorithmes en fonction de l’évolution des besoins de leurs expériences, R&D Vision a choisi un environnement standard de développement. Le code source des algorithmes développés spécifiquement dans le cadre de ce projet (code C/C++) a donc été fourni à NeuroPSI.
Vous souhaitez avoir plus d’informations, n’hésitez pas à nous contacter par mail à info@rd-vision.com.
